Kernel-based tests and their applications to single-cell data.

Nom de l'orateur
Anthony Ozier-Lafontaire
Etablissement de l'orateur
LMJL
Date et heure de l'exposé
Lieu de l'exposé
Salle des séminaires

Présentation d'une version préliminaire de sa soutenance de thèse :

Les technologies de single-cell génèrent des données qui présentent de nombreux défis, il y a beaucoup d'observations, elles sont en grande dimension et souvent parcimonieuses. De nombreuses expériences de biologie consistent à comparer des conditions. L'objet de la thèse est de développer un ensemble d'outils qui permet de comparer des échantillons de données issues des technologies single-cell afin de détecter et éventuellement décrire les différences qui existent. Pour cela, j'applique les tests de comparaison de deux échantillons basés sur les méthodes à noyaux existants et propose un nouveau test qui généralise ces méthodes pour un design expérimental quelconque. Je discuterai aussi l'implémentation et l'utilisation des tests. Afin que ces outils soient accessibles et utilisables par des non-spécialistes, je propose un ensemble d'outils pour interpréter les résultats et identifier les observations ou les groupes d'observations influentes.